生物多样性是指在一定时间和一定地区所有生物（动物、植物、微生物）、物种及其遗传变异和生态系统的复杂性总称。它包括遗传多样性、物种多样性和生态系统多样性三个层次。

可可西里自然保护区是目前世界上原始生态环境保存最完好的地区之一，是野生动物的天堂，藏羚羊是可可西里自然保护区的重点保护动物之一。保护藏羚羊的目的主要在于保护基因多样性和物种多样性，故选D。