1、基因库是指种群中所有个体所含的全部基因。种群中每个个体所含有的基因，只是种群基因库的一个组成部分。

2、生殖隔离是指种群间的个体不能自由交配，或者交配后不能产生可育后代的现象。这种不能杂交或能杂交而不能产生可育后代是生殖隔离。生殖隔离是新物种形成的标志。

3、生物的进化历程可概括为：从原核生物到真核生物，从无性生殖到有性生殖，由简单到复杂，由水生到陆生，由低等到高等。

A. 种群中存在的可遗传变异是自然选择的前提，也是生物进化的前提，环境是直接对表现型进行选择，间接对基因型进行选择，A错误；

B. 自然选择通过定向改变种群的基因频率使生物朝着一定的方向进化，自然选择不是进化的唯一因素，但却是适应性进化的唯一因素,B错误；

C. 生物进化过程中，种群基因频率一定改变，C错误；

D. 基因频率改变一定导致基因型频率改变；但基因型频率改变并不能证明生物进化，因为生物进化的实质是种群基因频率的该变，而基因型频率改变并不一定导致基因频率改变，D正确。

故选D。