从土壤中分离微生物的一般步骤是：土壤取样、选择培养、梯度稀释、涂布培养和筛选菌株。选择培养基的目的是筛选目的菌，在固体培养基上接种的方法通常是稀释涂布平板法和平板划线法。接种过程中培养基、接种器具要灭菌，操作者的双手和环境要消毒。

（1）给农作物施用尿素，主要是为了给植物提供氮元素，过量施用随水土流失后易造成水体污染，这种现象叫水体富营养化。为了筛选能分解尿素的细菌，在配制培养基时需要添加KH2PO4 和Na2HPO4，其作用有为细菌生长提供无机营养，作为缓冲剂保持细胞生长过程中pH。

（2）要从土壤中分离目标菌，关键的实验思路是用尿素为唯一氮源的培养基选择培养。理由是不能合成脲酶微生物无法分解尿素获取氮源，生长受到抑制。

（3）为对分离得到的菌种作进一步的鉴定，常在固体培养基中加入酚红试剂，若菌落周围出现红色环，可以初步鉴定该种细菌为目标菌，其原理是目标菌产生的脲酶催化尿素分解生成氨，使PH值上升，酚红试剂在碱性条件下由无色变红，出现红色环。

（4）运用固定化脲酶技术处理含尿素废水时应采用化学结合和（或）物理吸附法对脲酶进行固定化，理由是酶分子很小，容易被吸附或结合。