分析题干信息可知，雄性的育性由细胞核基因和细胞质基因共同控制，基因型包括：N（RR）、N（Rr）、N（rr）、S（RR）、S（Rr）、S（rr）。由于“只有细胞质和细胞核中均为雄性不育基因时，个体才表现为雄性不育”，因此只有S（rr）表现雄性不育，其它均为可育。​

A、N（S）基因的遗传表现为母系遗传，A正确；

B、 遗传定律适用于进行有性生殖的真核生物的细胞核遗传，细胞质中基因的遗传不遵循基因的分离定律或基因的自由组合定律，B错误；

C、雄性不育植株在杂交育种中最显著的优点是不用对母本进行去雄处理，C正确；

D、水稻细胞质基因与核基因的遗传信息的传递均遵循中心法则，D正确。

​故选B。