生命系统的结构层次：

动物：细胞→组织→器官→系统→个体→种群→群落→生态系统→生物圈

植物：细胞→组织→器官→个体→种群→群落→生态系统→生物圈

单细胞生物：个体（细胞）→种群→群落→生态系统→生物圈

A.细胞是最基本的生命系统，A错误；

B.单细胞生物依靠单个细胞独立完成所有的生命活动，B错误；

C.一个酵母菌既是生命系统的细胞层次又是个体层次，C正确；

D.培养皿中的大肠杆菌是一个种群，D错误。

故选C。