解：A、生物进化的证据有化石证据、比较解剖学上的证据、胚胎学上的证据等，在研究生物进化的过程中，化石是最重要的、比较全面的证据，化石是由古代生物的遗体、遗物或生活痕迹等，由于某种原因被埋藏在地下，经过漫长的年代和复杂的变化而形成的．化石在地层中出现的先后顺序，说明了生物是由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生逐渐进化而来的，始祖鸟化石说明了鸟类是由古代的爬行动物进化来的等；而比较解剖学上的同源器官只是证明了具有同源器官的生物具有共同的原始祖先；胚胎学上的证据（如鳃裂）只是说明了古代脊椎动物的原始祖先都生活在水中．符合题意．

B、原始生命起源于原始的海洋，原始生命诞生的标志的是出现原始的新陈代谢和个体增殖等生命的特征，不符合题意．

C、在研究生物的进化的过程中，化石是重要的证据，越古老的地层中，形成化石的生物越简单、低等、水生生物较多．越晚近的地层中，形成化石的生物越复杂、高等、陆生生物较多，因此地层中不同地质年代的化石揭示了生物进化的顺序．不符合题意．

D、米勒的实验向人们证实，生命起源的第一步，从无机小分子物质形成有机小分子物质，在原始地球的条件下是完全可能实现的．不符合题意．

故选：A

【考点精析】解答此题的关键在于理解化石证据的相关知识，掌握化石在地层中的分布规律：越古老的地层中，成为化石的生物越简单、越低等，以水生生物为主；越晚近的地层中，成为化石的生物越复杂、越高等，以陆生生物为主．