模型是人们为了某种特定目的而对认识所作的一种简化的概括性的描述，模型构建是生物学教学、研究和学习的一种重要方法。高中生物《分子与细胞》提出模型的形式包括物理模型、概念模型和数学模型等。

（1）物理模型是以实物或图画形式直观地表达认识对象的特征。

（2）概念模型 通过分析大量的具体形象，分类并揭示其共同本质，将其本质凝结在概念中，把各类对象的关系用概念与概念之间的关系来表述，用文字和符号突出表达对象的主要特征和联系。例如：用光合作用图解描述光合作用的主要反应过程，甲状腺激素的分级调节等。

（3）数学模型是用来描述一个系统或它的性质的数学形式。对研究对象的生命本质和运动规律进行具体的分析、综合，用适当的数学形式如，数学方程式、关系式、曲线图和表格等来表达，从而依据现象作出判断和预测。例如：细菌繁殖N代以后的数量Nn＝2n，孟德尔的杂交实验“高茎：矮茎＝3：1”，酶活性受温度影响示意图等。

A、制作的真核细胞的三维结构模型属于物理模型，A错误；

B、利用废旧物品制作的生物膜模型属于物理模型，B错误；

C、构建达尔文自然选择学说的解释模型属于概念模型，C错误；

D、建立理想条件下某种细菌的增长模型属于数学模型，D正确。

故选D。