根据“无中生有为隐性”可判断显隐性，亲本均为蓝羽，子代蓝羽：白羽=3：1，可判断蓝羽为显性性状。由题意“长喙为显性”，根据一只蓝羽长喙雄性和一只蓝羽短喙雌性进行多次杂交，F1中，长喙：短喙＝1：1，可知控制喙的长短的等位基因可能位于常染色体上，也可能位于Z染色体上。若要进一步判断，可选择短喙的雄性和长喙的雌性杂交，观察并统计子代的表现型和比例，进而判断。可设羽色由A、a基因控制，喙的长短由B、b基因控制。

（1）根据亲代都是蓝羽，子代出现了白羽（性状分离），可判断蓝羽是显性性状。

（2）控制羽毛颜色的相关基因位于常染色体上，亲本均为蓝羽，子代蓝羽：白羽=3：1，可知亲本的基因型均为Aa，F1中的蓝羽鸟的基因型为1/3AA、2/3Aa，产生配子种类和比例为A：a=2：1，让F1中的蓝羽鸟随机交配（只考虑羽毛颜色），F2蓝羽鸟中纯合子所占的比例为（2/3×2/3）÷（1-1/3×1/3）=1/2。

（3）鸟类的性别决定方式为ZW型，雌鸟含有两条异型的性染色体，雄鸟含有两条同型的性染色体，为确定控制喙的长短的等位基因的位置，可选择隐性雄鸟和显性雌鸟进行杂交，所以可让F1中短喙雄性与长喙雌性杂交，观察并统计F2的表现型及比例。若F2中，长喙雄性：短喙雌性=1:1，则该等位基因位于Z染色体上；若F2中无论雌雄，长喙：短喙=1:1，则该等位基因位于常染色体上。